A tréner az idény elején vette át az együttes irányítását, azt követően, hogy befejezte szövetségi kapitányi ténykedését a belga válogatott mellett. A Bruges a Debrecen elleni kettős győzelemmel felkerült az Európa Liga főtáblájára. A D csoportban a Newcastle United és a Girondins Bordeaux mögött a harmadik helyen áll három fordulót követően, de még egyáltalán nem szállt el továbbjutási esélye, ugyanakkor a hazai bajnokságban gyengén szerepel. A szezon elején a bajnoki címre is esélyesként emlegetett együttes jó kezdés után a hétvégén sorozatban már a negyedik vereségét könyvelte el, emiatt pedig csak a hetedik.
Leekens helyére átmenetileg a tartalékcsapat edzője, Philippe Clement kerül. Belga sajtóértesülések szerint az elbocsájtott vezetőedzőnek hárommillió eurós lelépési pénz jár.